وظيفه واحد فراهم آوري اعضاي پيوندي شناسايي موارد مرگ مغزي در بيمارستانهای تحت پوشش، ويزيت موارد فوق ، تشخیص مرگ مغزی و صحبت با خانواده ها براي اهداي عضو مي باشد . واحدهاي فراهم آوري اعضاي پيوندي طبق دستور وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشكي بعد از تصويب لايحه اهداي عضو از موارد مرگ مغزي در سال 1380 در دانشگاه هاي علوم پزشكي كشور تاسيس شده اند. در سال 1368 امام راحل ( ره) به دنبال استفتای وزير بهداشت، درمان و آموزش پزشكي وقت جناب آقاي دكتر ايرج فاضل ، اهداي عضو از موارد مرگ مغزي را به شرط آنكه نجات جان انساني منوط به آن باشد، جايز فرمودند. مراحل قانوني و تصويب لايحه مربوطه تا سال 1380 به طول انجاميد .بعد از تصويب مجلس در سال 1380، كليه دانشگاه هاي علوم پزشكي كشور موظف به تاسيس واحد فراهم آوري اعضاي پيوندي از موارد مرگ مغزي شدند. واحد     فراهم آوري اعضاي پيوندي دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي نيز در همين راستا در سال1380 تاسيس و فعاليت خود را آغاز كرد. مشكل اصلي عدم آگاهي مردم با مفهوم مرگ مغزي، تفاوت آن با كماي عميق، غير قابل برگشت بودن آن و نيز پذيرش اهداي عضو از مورد مرگ مغزي بود . به همين دليل در سال اول در طول يكسال فقط در 5 مورد مرگ مغزي اجازه اهداي عضو از خانواده كسب شد و اهداي عضو صورت گرفت . با توجه به لزوم آگاه سازي و فرهنگ سازي در اين زمينه ، واحد فراهم آوري اعضاي پيوندي اقدام به فعاليت گسترده در زمينه هاي فرهنگي مرتبط با اهداي عضو و مرگ مغزي كرد و با استفاده از رسانه ها ، هنرمندان ، ورزشكاران ، روحانيون و اصحاب رسانه با تهيه گزارشهاي متعدد از موارد اهداي عضو از مرگ مغزی، برنامه هاي آموزشي در صدا و سيما، نوشتارهاي روزنامه اي ، استفاده از هنرمندان ،ورزشكاران، روحانيون و اصحاب رسانه به عنوان سفير اهداي عضو ، اهداي زندگي براي ترويج فرهنگ اهداي عضو فعاليت گسترده اي را انجام داد و موفق شد درصد رضايت گيري براي اهداي عضو را از 5% به 85% رسانده و اهداي عضو را از 5 مورد در سال 1380 به 216 مورد در سال 1395 برساند. واحد فراهم آوري اعضاي پيوندي تحت نظر مستقيم رياست محترم دانشگاه و وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشكي فعاليت مي كند و ارتباطي با گيرنده هاي عضو ندارد. موارد مرگ مغزي شناسايي شده كه رضايت به اهداي عضو مي دهند به وزارت بهداشت، درمان اعلام و چون نیازمندان به پیوند عضو سراسر کشور در سامانه وزارت بهداشت، درمان  ثبت نام شده اند،  بسته به سن ، گروه خوني و شدت بيماري براي دريافت عضو اولويت بندي شده و گيرنده هاي نهايي توسط وزارت بهداشت و درمان مشخص مي شوند. موارد مرگ مغزي كه از بيمارستانهاي تابعه به واحد فراهم آوري اعضاي پيوندي منتقل مي شود تحت آزمايشات تكميلي تاييد مرگ مغزي قرار گرفته توسط 5 متخصص معتمد وزارت بهداشت و درمان كه هيچ ارتباطي با واحد فراهم آوري اعضا و پیوند عضو ندارند ويزيت و در صورت تاييد مرگ مغزي اجازه نهايي از خانواده گرفته مي شود . اين متخصصان، متخصص داخلي مغز و اعصاب، جراحي مغز واعصاب، بيهوشي ، داخلي و پزشكي قانوني مي باشند. در اين فاصله گيرنده ها در سراسر كشور مشخص و مورد مرگ مغزي به اتاق عمل منتقل و بعد از اداي احترام، برداشت اعضا توسط تيم هاي جراحي انجام و به مقصد نهايي ارسال مي شود. عمل جراحي برداشت اعضا به روشي كه خط برشي معلوم نباشد انجام و سپس ترميم مي شود . به طوري كه پيكر عزيز اهداكننده دچار هيچ تغيير شكلي نمي شود. سپس پيكر اهداكننده عزيز به مكان آرامش ابدي منتقل مي شود . در كل فرآيند فوق حدود 150 نفر فعاليت مي كنند تا عضو اهدايي به گيرنده مورد نظر برسد .